Dùng phần mềm đóng gói hay cần phải chỉnh sửa theo mô hình doanh nghiệp
Hiện nay có thể thấy 2 xu hướng là phần mềm kế toàn đóng gói và phần mềm kế toán có chỉnh sửa theo yêu cầu doanh nghiệp. Việc lựa chọn nào cũng có ưu và nhược điểm, nếu phần mềm đóng gói thì giá thành sẽ rẽ hơn, chi phí vận hành thấp, nhà cung cấp dẽ nâng cấp và bảo hành tuy nhiên là có thể sẽ không phù hợp với doanh nghiệp đặt thù ví dụ bài toán giá thành sản phẩm, hoặc về các quy trình mua bán hàng hóa.
Lấy trường hợp của một công ty Thủy sản, liệu 1 phần mềm kế toán đóng gói có thể ứng dụng được không? khi yêu cầu của nghành này là phải có chức năng nhảy size (cở) tôm khi nhập liệu, hoặc phải có bảng giá mua thay đổi hàng ngày …v.v.v
Ngược lại nếu 1 công ty dịch vụ bảo vệ đơn thuần thì kế toán có cần phải bổ sung các chức năng gì không, khi mà tất cả hóa đơn đầu vào đầu ra cũng chỉ là dịch vụ
Nên lựa chọn phần mềm đóng gói trong trường hợp doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực dich vụ và thương mại đơn thuần, hoặc chỉ dùng để cung cấp báo cáo tài chính cho cơ quan thuế. Một số nhà cung cấp hiện nay như : MISA, Lạc Việt, 1A… là theo mô hình này. Phần mềm kế toán có chỉnh sửa theo yêu cầu doanh nghiệp có thể kể đến như : Fast Accounting, Nano Accounting, Bravo…

Hãy lựa chọn dịch vụ tư vấn thay vì lựa chọn chức năng của phần mềm
Dù phần mềm có nhiều chức năng, công nghệ tiên tiến, nhưng khi ứng dụng chưa chắc đã mang lại hiệu quả cao cho doanh nghiệp, phần mềm kế toán cũng vậy hay xem như là một công cụ (tool) hổ trợ cho công việc của kế toán của bạn, do vậy điều cần nhất là khả năng vận hành nó. Muốn vậy phải có người tư vấn ứng dụng thực sự có kinh nghiệm về phần mềm cũng như nghiệp vụ về kế toán, có như vậy mới giúp bạn phát huy hết các chức năng của phần mềm, cũng như việc hổ trợ bạn sau này khi làm báo cáo tài chính hoặc kết xuất các báo cáo khách theo yêu cầu.
Hiện nay các nhà cung cấp phần mềm kế toán đều có thể đến trực tiếp để trao đổi với bạn về nghiệp vụ cũng như trình bày cho bạn về sản phẩm của họ. Nên bạn có thể yêu cầu nhân viên tư vấn có kinh nghiệm khi tiến hành mua ứng dụng

Mua phần mềm kế toán vào các tháng 7 hoặc 8 trong năm
Bạn đừng nghĩ là sẽ tốt hơn nếu mua đầu năm hoặc cuối năm để ứng dụng cho năm sau. Bởi vì đó là điều ai cũng nghĩ như vậy, thời điểm này bạn phải lo hoặc là quyết toán thuế, hoặc là báo cáo tài chính cho doanh nghiệp mình như vây bạn sẽ không có thời gian cho phần mềm kế toán mới. Hãy lựa chọn phần mềm khi bạn có đủ thời gian và các cá nhân trong nhóm của bạn cũng vậy. Nên thời gian tốt nhất có thể là tháng 7,8 . Hơn nữa đây là lúc các nhân viên tư vấn của các công ty cung cấp phần mềm cũng không có nhiều việc để làm, nên bạn có thể có được nhân viên dày dạn kinh nghiệm tư vấn ứng dụng cho doanh nghiệp mình

Dùng thử phần mềm trước khi mua
Như đã nói ở điều trên, khi bạn có thời gian rồi thì không nên vội vả. Hãy yêu cầu nhà cung cấp cài đặt phiên bản dùng thử (Demo) cho bạn khi có thể
Với tốc độ internet hiện nay, việc cài đặt qua mạng không có gì phức tạp bạn chỉ cần 1 phần mềm remote từ xa như : Teamview, Logmein hoặc Remote Desktop có sẵn trong window. Vì vậy hãy tận dụng nó ,bạn sẽ không làm phiền nhiều đến nhà cung cấp. Các cá nhân trong nhóm của bạn sẽ được trải nghiệm qua trước khi dùng chính thức, như vậy sẽ có sự am hiểu nhất định vào phần mềm khi đặt ra câu hỏi cho nhà cung cấp

Xem lại hệ thống máy tính và mạng Lan (mang nội bộ) trong công ty
Nếu bạn không có kinh nghiệm trong lĩnh vực IT – Phần cứng thì hãy nhờ người quen hay ngay cả nhân viên kinh doanh của nhà cung cấp phần mềm kế toán, xem lại các máy tính bạn đang dùng có thể đáp ứng được phần mềm không? , hệ thống mạng Lan (nội bộ) trong công ty có đủ băng thông để chạy không? Vì nếu bạn dùng 1 máy chủ thì không có gì phức tạp, tuy nhiên bạn phải chia sẽ tài nguyên khi dùng trong nhóm , do đó các máy trạm khác phải đủ mạnh cũng như kết nối mạng đến máy chủ phải ổn định